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初生仔猪调节体温的中枢神经系统尚未发育完善，仔猪出生20天内体温受环境变化的影响很大：当外界环境温度比仔猪的体温低很多时，仔猪的体温迅速下降，代谢减弱，机体的免疫力降低，常易发生各种疾病，特别是腹泻病。
2、新生仔猪消化器官不发达，消化功能不完善 胃上皮细胞仅能分泌乳糖酶，胃内仅含有凝乳酸酶，胃和胰蛋白酶等消化酶皆很少，其活性也很低，胃酸缺乏，尤其是盐酸，因此不利于抑制有害菌的繁殖。（因为仔猪胃液PH值低于4时才能有利于蛋白质消化，才能使大量病原菌灭活。）
3、规模化猪场仔猪早期断奶综合症应激过强促进致病，尤其是实施早期断奶 其环境温度、饲料营养、管理条件未跟上需要，更易致病。研究显示：早期断奶应激可降低仔猪体内循环抗体水平，抑制细胞免疫力，引起仔猪抗病力减弱，容易发生腹泻。
4、营养和饲养管理不当所致 由于母猪无奶综合症而导致仔猪低血糖，仔猪由不活泼到水样腹泻，严重的由虚弱发展到低温、昏迷或神经症状。由于对仔猪突然强制补料或吃不良的奶汁和饲料，可导致乳猪发生诱导性腹泻或营养性腹泻。仔猪活泼有食欲，无全身症状，仅见消化不良的稀臭、粥状粪便。
5、由细菌性病原导致：⑴黄痢 1-7日龄的仔猪发病，四季均可发病，以第一胎母猪所产仔猪或环境卫生条件较差的发病率较高；日龄越小死亡率越高。排黄色稀粪，内含凝乳小片，排粪失禁，脱水消瘦，衰竭死亡。⑵红痢 四季可发病，主要是1-3日龄仔猪发病，多为C型魏氏梭菌产生外毒素致病，发病急剧，病程短促，大多于1-3日内死亡，排出浅红色或红褐色稀粪，以后排含灰色坏死组织碎片，逐步变为“米粥”状粪便。⑶白痢 四季可发病，主要是10-20日龄仔猪发病，饲养管理差、气温剧变、阴雨连绵等多发，病程2-10天，以排出乳白色或灰色腥臭的糊状稀粪为特征。⑷仔猪副伤寒 主要发生于多雨潮湿季节，多见于营养、卫生状况差的猪场流行。主要表现为慢性结肠炎与肠型猪瘟相似的呈急性败血症，经1-6天死亡。
6、由病毒性原因导致： ⑴猪传染性胃肠炎 冬春季节多发，各种年龄猪均可感染发病，日龄越小的仔猪危害越大，仔猪呕吐、水样腹泻，最后脱水死亡或成为僵猪，成年猪轻度水样腹泻（2）轮状病毒病 早春和晚冬季节多发，以10-20日龄的仔猪易感，新疫区偶有暴发，多为散发，成年猪多为隐性感染，仔猪呕吐、腹泻，粪便黄色或黑色，较腥臭，呈水泻样或糊状⑶猪流行性腹泻 各种年龄猪均可发病，多在冬春发生，夏季也偶有发生，与猪传染性胃肠炎相比，传播速度较慢，病死率较低，腹泻症状也较轻，常与胃肠炎混合感染⑷伪狂犬病 冬春季节多发，病猪精神沉郁、呕吐、腹泻、发抖，部分有后退、转圈等神经症状。
预防仔猪腹泻的综合措施
1 、做到科学饲养，防止怀孕母猪过肥或过瘦 要获得健壮的仔猪，必须保证母猪饲喂营养全面、均衡的饲料。（1）一般在怀孕前期应适当限饲，但此时也是胎儿组织器官形成的阶段，对饲料中蛋白质和维生素的质量有较高要求，同时可多喂青绿多汁饲料。（2）怀孕后期应采用高标准饲养，以保证营养供给，促进胎儿正常发育，减少母猪脂肪消耗，为产后恢复体力和初乳积蓄营养。（3）产仔当天不要喂精料，适当饲喂麸皮汤，产后第三天起逐渐增加母猪饲喂量，可防止因母猪产后不食、便秘、缺奶而导致仔猪腹泻。
2、做好母猪分娩前的免疫接种工作和产后母猪的护理
⑴母猪于产前40-45天注射“猪传染性胃肠炎—流行性腹泻—轮状病毒”三联苗；于产前28天注射“伪狂犬基因缺失苗”。
⑵待产母猪进入分娩舍前，必须对产栏和母猪进行彻底消毒，有条件的猪场可实行全进全出的方法，更有利于杜绝病原微生物的交叉感染。预防仔猪腹泻的综合措施：
⑶在产一月开始添加牲命1号，改善奶水质量。
