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消毒最开始由于受到消毒剂的制约（最开始的消毒剂的刺激性大、毒性大，不安全）。因此，只能对环境以及空圈舍进行消毒，在圈舍内饲养猪的情况下就无法进行消毒。后来随着消毒剂的发展逐渐研发出一些无刺激、无毒、安全的消毒剂，以双链季铵盐的百毒杀为代表，能够在有猪存在的条件下进行消毒，填补了带猪消毒这块消毒的空白，有效地切断饲养环节疾病的传播。
由于猪的嗅觉很是灵敏，因此在选择带猪消毒的消毒剂时一定要注意选择无刺激性、无毒的消毒剂，醋酸、福尔马林只能用于空舍消毒，用在带猪消毒上会由于其刺激性使猪产生应激。
一般的胺碘、复合碘类消毒药对猪体没有影响。能够带猪消毒的消毒药有很多种，如0.5%的过氧乙酸、百毒杀、新洁尔灭等，这些消毒药对人喝猪都没有刺激性，也无异味，可以优先选用。
如果每栋猪舍饲养猪只1000头左右，仅需20分钟就可以消毒完毕。经测算，带猪消毒一次可以杀灭猪舍85%以上的病毒感染量，对健康养猪是有好处的。带猪消毒采用喷雾的方式，一般情况下每周一到两次，但是至少一次。
二、消毒时间
掌握好温湿度。一般温度相对高时消毒效果更好些，所以每天上午9：30～11：30、下午3：30～5：00进行消毒较好。湿度在60％～70％时进行消毒效果更好些，舍温在10℃～30℃时，作用30分钟即可取得良好效果。
猪场发生了疫病后应全群带猪消毒，可以用碘制剂对全群猪进行喷雾消毒，具体稀释浓度看消毒剂的使用说明。碘伏也可用于水的消毒，特别是饮用水的紧急处理，用8ppm有效碘，作用10分钟，就能杀死水中存在的病原微生物，也可以用“特效碘消毒液”，该消毒液为复方络合碘溶液，具有广谱、长效、无毒、无异味、无刺激、无腐蚀、无公害等特点。在实际应用中，常用0.3%特效碘配成60倍的稀释液带猪消毒，对控制疫病的流行很有效。
三、消毒注意事项
猪舍的漏粪地板下是粪沟，粪沟长年累月存着粪便，地板下环境潮湿、沾满粪水。这里是卫生、消毒的死角，大剂量投放消毒剂不现实。为什么一旦感染上疫病，往往反复发作就是这个道理。所以，要定期进行带猪消毒。消毒前，要彻底清扫粪便，地面要打扫干净，这样才能使消毒剂发挥作用。
在带猪消毒的过程中，一定要让猪体、地面潮湿，以保证消毒效果。需要注意的是带猪消毒时地面要保持湿润，但平常要保持干燥。猪如果总在潮湿的地面上，会损失大量热能，而且猪的腿关节也容易患上风湿病，从而影响猪的起卧和食欲。
带猪消毒表面上是增加了工作量，但实际上对养猪技术人员的要求更高了。带猪消毒时，最好使用电动高压柱塞泵。由于水雾颗粒是微米级的，非常细小，能够吸附空气中的杂质，达到降尘、消毒、清理卫生死角的功效，可以杀灭、降低环境中病菌、病毒含量，降低疫病发生，而且高压水泵运行维护成本很低。
