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从2010年春节前后，一直到现在，猪群病毒性腹泻给养殖业带来了很大的打击和巨大的经济损失。当前腹泻性疫病爆发流行，病因复杂，危害增大。
除了引起猪群腹泻的传统的三大病原流行性腹泻、传染性胃肠炎和轮状病毒外，最新报道的库布病毒（kobuvirus）、博卡病毒(bocavirus)、诺如病毒(norovirus)在猪群腹泻发病过程中也起了很重要的作用，这三种病毒在猪场的检出率非常高。，目前所流行的腹泻，从发病猪场、病料、粪便当中检出的最高是流行性腹泻病毒、库布病毒（kobuvirus）和博卡病毒(bocavirus)三种，这三种病毒的感染率是最高的。
但是究竟是三种病毒的其中一种在猪群腹泻的发病过程中起了重要作用还是三种病毒混合感染协同起作用，这个问题还有待于更进一步深入的研究，现在对于病毒的分离鉴定工作很多单位都在做。而除了引起猪群腹泻的病毒性因素之外，免疫抑制、细菌性腹泻、饲料霉菌毒素、生物安全、环境因素等等这些都是诱导和促进腹泻发生的重要原因。
对当前养猪业造成巨大经济损失的三大疾病：腹泻（多病原混合感染或者多病原引起）、呼吸道问题、繁殖障碍（引起母猪返情，配不上种，产死胎、产木乃伊胎、产弱仔）等，这三大类型疾病是当前影响我们养猪业的最主要的原因。 第一、免疫抑制病威胁逐渐加剧 蓝耳、圆环病毒、附红细胞体等免疫抑制性疾病，破坏淋巴细胞和免疫系统，从而降低机体的免疫力，机体容易发生继发感染；而猪群饲喂的饲料霉变，霉菌毒素、烟曲霉毒素等毒素导致机体发生免疫抑制，使猪群长期处于一个亚健康威胁的状态。同时还影响猪瘟、伪狂犬等疫苗的抗体水平或对其他疾病的抵抗力下降，进而激发猪群感染呼吸系统疾病。
第二、多种病原的混合感染越来越普遍 细菌之间的混合感染主要有三种：副猪嗜血杆菌和链球菌混合感染，肠外致病性大肠杆菌、副猪嗜血杆菌和链球菌的混合感染，胸膜肺炎放线杆菌和巴氏杆菌的混合感染，细菌之间的混合感染主要危害的是肥猪和种猪。此外，陈院士还提到，有一个不容忽视的问题是，最近一两年，肥猪或种猪因胸膜肺炎放线杆菌和巴氏杆菌导致发病死亡的现象越来越多。他表示，1999年到2004年间，由他第一次分离出胸膜肺炎，当时主要是以胸膜肺炎为主，后来2004年至2005年又分离出副猪嗜血杆菌后，副猪嗜血杆菌非常严重，相反胸膜肺炎有所下降。这两年胸膜肺炎又有大量抬头的的趋势，而且国外引进的种猪十有八九是有胸膜肺炎。副猪嗜血杆菌和链球菌的混合感染在保育舍和生长前期是一个大问题。
病毒之间的混合感染主要是蓝耳病毒、圆环病毒和猪瘟之间的混合感染，猪瘟和伪狂犬也会混合感染等等。再者就是细菌病毒寄生虫的混合感染。而提到高热病，陈焕春院士表示，高热病不能当成是一个兵，高热病是蓝耳病病毒、圆环病毒、加上附红细胞体，又继发了副猪嗜血杆菌、链球菌、大肠杆菌、胸膜肺炎这些高死亡率的细菌性疾病等等而导致的。他曾经接触过一些发生高热病的猪场，猪群的成活率不足20%，而通过分析病原然后进行一一控制，现在猪场的成活率达到了95%。他还介绍，在中小型的养猪场细菌病毒寄生虫再加上一个附红细胞体的混合感染是主要的因素，而规模化养殖场，圆环病毒、蓝耳病和细菌混合感染的现象比较严重。
第三、细菌性疾病不容忽视，在猪群发病致死中扮演者重要的角色 对于猪场细菌性疾病对不同阶段的猪的影响和发病情况，陈焕春表示在猪场的产仔舍，仔猪出现严重的关节炎，大量的耳尖发绀、尾尖发紫，腹部、下肢发紫等症状，则肯定是副猪嗜血杆菌，因为链球菌没有这么严重；而从产仔房到了保育舍再到分散舍，主要问题是副猪嗜血、链球菌或者是大肠杆菌比较严重，其中副猪嗜血杆菌危害4月龄以内的猪，4月龄以上发病猪不是副猪嗜血杆菌病；4月龄以上或者生长为生长肥育的后期或者种猪，大量地发生呼吸道的问题或者急性死亡或者慢性的疾病则主要是胸膜肺炎。
同时，陈焕春还介绍了他的研究团队历年对猪群细菌分离鉴定的统计结果，2003.10至2011.1，共分离鉴定细菌10817株，其中链球菌4274株（39.51%）、副猪嗜血杆菌3088株（28.55%）、肠外致病性大肠杆菌1213株（11.21%）、巴氏杆菌652株（6.03%）。这些分离鉴定结果表明，链球菌等几种细菌已成为影响我国养猪生产的主要病原菌。此外，胸膜肺炎、沙门氏菌等常见的病原菌也严重威胁规模化养猪业的健康生产。陈焕春还表示，实际临床上，副猪嗜血杆菌的检出率可能要比链球菌还高，因为副猪嗜血的分离培养困难一些，而链球菌分离培养相对容易细菌的耐药性日趋严重，引发公共卫生问题 现在的养猪生产过程中存在这样一个问题，猪病很多，因此就过分地使用抗生素类药物进行药物治疗或保健，从而导致现在致病菌的耐药谱广，甚至有些疾病出现无药可治的情况。
对此，陈焕春表示要尽量减少饲料中抗生素的添加，减少猪病防控过程中抗生素的使用，而在非要使用的情况下尽量先进行药敏实验，做到有的放矢。 第五、疾病的多发，爆发、群发已经没有了明显的季节性，且与日常的生产管理、饲养工艺更为密切； 现在猪群的猪群处于高病原压力下，猪群长期带毒，导致猪群的基础免疫低下，疾病的发生已经没有了明显的季节性。而且猪场缺乏配套的合理的免疫程序与疾病预警机制，兽医管理理念跟不上，防疫意识淡薄，执行力不强等等，导致猪病越来越复杂。
对此，陈焕春表示要进行“未病先治”，做好猪场病原学工作，建立病原感染谱。但是现在猪场在进行猪病防控的过程中往往存在一个误区：过多地进行猪群抗体水平监测。陈焕春表示抗体水平的形成很复杂，有的是打疫苗引起的，有的是自然感染的野毒引起的。现在把疫苗引起的抗体水平和野毒感染引起的抗体水平区分开还不太可能，虽然目前存在可区分的如伪狂犬、五号病，但区分其他的疾病还是比较困难。抗体监测是野毒引起的还是打疫苗引起的是分不清的；第二，有些病有的疫苗不是靠抗体去免疫的，比如伪狂犬，你去检测他的抗体是没有用的，他是靠细胞免疫起作用的，所以用抗体水平评价伪狂犬疫苗是合适。
动物的日龄，在产仔房母源抗体的水平比较高，但是进入到保育舍，任何病原、任何疫苗，你去检测保育舍的猪抗体水平都是最低的，然后到肥猪慢慢升高，最高的是母猪，因为打的针多了，时间长了。 要解决当前猪病的问题，关键一个是做好病原学的工作。因为不管是在你的死亡的还是活着的猪体内都好，你只要检测出病原了，他要么是急性死亡致病性很强的，要么是他也造成免疫抑制活着带毒带菌都是有影响的，那个心肝脾肺肾正常的动物应该是分不出病原菌的，有病原菌就说明你的机体可能不正常。猪场要把猪病控制好，关键是做好病原学的诊断和检测的工作，比抗体监测更重要。
