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5.引入基因的成本和安全性问题
因购买精液配种而引入疫病比购买种猪的机会要小得多。所以从国内、国外引入猪的冷冻精液比引进种猪安全得多。虽然冷冻精液的受胎率和产仔数还不够理想，但达到的水平还能为养猪场接受，因此，通过购买冷冻精液引入新的基因，仍不失为一个十分安全的方法。中小型猪场，自繁自养，常常因为群体过小，容易发生近交，从其它猪场引入新鲜精液或冷冻精液，是防止近交、引进新的基因的重要方法。大型猪场在杜洛克种猪群中引入皮特兰的基因也是这样。皮特兰猪虽然瘦肉率高，但因其兴奋性高，容易受到环境应激，特别不易饲养，而且pse猪比例较大，所以一般不直接用作终端父本。
因为作终端父本，商品代带有一半的皮特兰血统，使商品代不易饲养，还容易出现pse猪。如果杂交生产皮杜公猪，皮杜公猪不仅具有繁殖方面的杂种优势(性欲和生精力较纯种强)，而且皮杜公猪作终端父本，商品代仅有四分之一的皮特兰血统，因此不太容易出现环境应激，商品代瘦肉率高，一般也不会产生pse猪。
在今天禁止使用兴奋剂和追求高瘦肉率的情况下，应用这种方法是值得考虑的。但因为皮杜公猪需要量较少，所以即使猪场引进了皮特兰公猪，也很少使用。一个猪场为引入皮特兰血统而购买皮特兰种公猪，显然是不合算的。而购买皮特兰公猪的精液，则不失为低成本引入基因的方法。
6.中小型猪自繁自养生产种母猪问题
我国大型猪场生产商品猪，通常是以“大长”或“长大”二元母猪与有色品种(主要是杜洛克)公猪杂交生产“三元杂交商品猪”。中小型猪场一般是从大型猪场或育种场购买“长大”或“大长”二元母猪和杜洛克公猪来生产商品猪。但母猪利用三年到三年半后，就必须更新，必须再从其它猪场购买二元母猪。因为不了解母猪的基本情况，甚至有的养殖户在购母猪时，还不知道怎么选猪，结果购进的母猪遗传品质和繁殖性能并不理想，有些母猪甚至是头胎母猪所生或商品代。而轮回杂交生产种母猪的方法，能够使小型猪场也能实现自繁自养，这种方法在一些养猪发达的国家应用也相当普遍。
其方法是：用于生产种母猪的母猪应具备以下条件：1.经过一至二胎检验，繁殖性能可靠。2.后代发育良好，体型好，无畸形。3.不含有色毛血统的白色母猪。公猪应具备的条件是：1.纯种，并且种母猪群不含或只含本品种血统一半或一半以下。2.白色，并且不含有色毛血统。3.经过测定发育性良好。4.该品种繁殖性能良好。通常选择占种母猪群15%的优秀种母猪与白色种公猪杂交生产种母猪，而其它85%的种母猪则与杜洛克或其它有色种公猪杂交生产商品猪。
轮回杂交对种公猪的要求高(必须经过测定)，而且对于一个猪场来说利用的次数较少，因为生产种母猪不象生产商品猪那么多。所以一般从人工授精站或大型种猪场购买种公猪精液给母猪输精。因为所有种母猪均为经过检验的优秀母猪，而公猪是十分优秀的。所以，一代一代地选择下去，种母猪群的总体质量会逐步提高。每生产一头种母猪比购买种母猪成本要低得多。而且不需要重新购买种母猪，也减少了引入疫病的风险。如果有三至四个优秀的白色品种进行轮回杂交，效果更好。
7.母猪一个情期用多头公猪配种问题
在商品猪生产中，一头种母猪在一个配种情期中，最好用多头种公猪与之交配，以求获得更高的产仔数和仔猪发育更一致。在本交情况下，一般采用双重配，即在母猪的一次配种中，用两头种公猪在20分钟内分别与之交配。但双重配比一次配种，公猪的需要量增加了一倍。但在人工授精中，可以用更多头的公猪的精液混合给母猪输精。这种作法在养猪发达的国家应用相当普遍。
用多头公猪的精液给母猪输精，可使母猪的排出的卵子有更多的受精机会，可能有利于形成活力强的受精卵和胚胎，从而使母猪产出仔猪发育更均匀。而且对公猪数量的需要和不采用混合精液输精是一样的。
但用混合精液给母猪输精只适合生产商品猪，而不适合生产种猪，因为我们不能确定母猪所生仔猪的父亲是哪头公猪，除非两头公猪的后代很容易区别，例如用杜洛克公猪精液和皮特兰的精液混合给杜洛克母猪输精，后代中棕红色仔猪为杜洛克公猪的后代(即纯种杜洛克猪)，棕红色有黑斑的仔猪为皮特兰公猪的后代(即皮杜二元猪)。但这种情况在生产中并不多见。
8.异地配种问题
因为种公猪价格高，利用率低，所以种母猪数只有十几头左右的小型猪场可能不饲养种公猪，而依靠其它猪场的种公猪配种。但在本交情况下，存在许多弊端。一是受距离限制，尤其是将母猪驱赶到有种公猪的猪场，很不方便;二是容易传播疾病，中型猪场虽然有种公猪，但并不愿对外开展配种业务，因为有将其它猪场的疾病传入本场的风险。人工授精技术给异地配种提供了方便。只需安排人员到供精站购买精液或由供精站技术人员将精液送至猪场，必要时可由技术人员作示范操作。这样可使种公猪的配种范围达到方圆25~50千米。如果有很好包装，用特快专递，可使配种范围扩大到更远的地方。
9.初配公猪无法确定其精子有无受精能力问题
对一个即将用于配种的后备公猪来说，如果不对精液进行品质鉴定，就无法确定其精子有无受精能力。而本交情况下，很少猪场对公猪的精液进行品质鉴定。所以一头即将作种用的后备公猪可能在4～5个时间内，只能用来作母猪一个配种情期的第二次配种，第一次配种则采用生育力可靠的公猪配种。如果待鉴定的后备公猪配种的母猪产仔数正常(经产母猪窝产仔数11头以上)，仔猪也无异常，则这头后备公猪才能被试着当作种公猪使用。而人工授精对每份精液都要进行品质鉴定。尽管不能肯定所有项目都合格的精液就一定有受精能力，但一般情况下，品质合格的精液极少存在受精率问题。
