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蛋白饲料原料中，菜籽粕、棉籽粕、花生饼、向日葵仁饼等，比传统的蛋白饲料原料如豆粕，更容易污染霉菌毒素。当传统饲料原料的价格上涨的时候，饲料生产企业就会选择使用豆粕的替代品，而这就增加了霉菌毒素中毒的几率。副产品和饲料原料替代品的使用增多，虽然能降低饲料成本，但也使得引入污染霉菌毒素的原料的几率大大增加了。
饲料原料发霉变质
饲料原料中的玉米、豆粕、鱼粉等发霉变质，是导致鸡群霉菌毒素污染甚至中毒的直接原因。全球气候的变化，为霉菌生长繁殖提供了很好的条件。玉米在收获季节雨水过多，收割前在地里可能已经发霉，收割后不能及时晾晒，导致发霉变质。霉变玉米产生的毒素主要有黄曲霉菌、赤霉烯酮、呕吐霉素等。豆粕和鱼粉在保存过程中也会污染霉菌，并产生霉菌毒素。制霉菌素对以上霉菌毒素效果显著。
垫料污染
地面养鸡的垫料主要有花生壳、稻壳、麦秸、木屑等，在高温高湿环境下，这些垫料容易发霉。在养殖中采食垫料或者掉在垫料上的饲料，就可以导致霉菌感染或采食入霉菌毒素。
