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其中上海申联生物制品有限公司目前仅生产猪口蹄疫合成肽疫苗。以上生产企业的生产设施均进行了GMP改造并通过了农业部的GMP验收。疫苗生产工艺的全过程严格实行GMP管理。
国内取得生产文号的猪口蹄疫疫苗品种主要有：O型灭活疫苗和合成肽疫苗。已经获得新兽药证书，尚未取得生产文号的猪口蹄疫是O型基因工程疫苗。
已注册用于生产猪口蹄疫灭活疫苗毒种主要有：
O型：OS/99，OR/80、OZK/93主要用于O型口蹄疫灭活疫苗生产。
亚洲I型：AKT/03、LC/96、KZ/03、Asia-1-JSL/HeNZK/06。
从2008年开始，根据亚洲I型的流行趋势及实际保护效果，农业部规定，对于口蹄疫O型、亚洲I型二价灭活疫苗生产，亚洲I型部分统一采用Asia-1-JSL/HeNZK/06株。
从2009年开始猪用口蹄疫灭活疫苗在原有种毒基础上增加OZK/93株，生产双组分疫苗。
