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疫苗的免疫，前期需要做病毒的监测，当猪群病毒阳性率大于等于20%时才考虑使用疫苗。疫苗的免疫程序各个场也不同，根据临床病毒的PCR检测或ELISA检测的数据制定最佳的免疫时间。
对此，长江食品集团总经理麦月仪认为，能做到用抗体水平数据去指导疫苗免疫次数、时间当然最好，但工作量太大。“每做一次检测都要抽血，别说猪受不了这折腾，人也不愿意干。”麦月仪认为，如果根据每个季度猪群健康体检报告的数据来制定场内的免疫程序会更加合理。这不但做到了对往年的统计数据充分利用，并且避免了当前反复抽血的繁琐过程。“每次抽血测抗体，成本非常高。并非一般猪场能承受。”麦月仪说。的确，据余益耀介绍，2011年他公司光购买试剂盒的支出就高达60万，远远高出其他养殖场2-5万/年的检查成本。
广东省农业科学院兽医研究所副所长宋长绪则认为，采用这种数据分析法指导生产，理论上很科学，但实际操作中问题很多。“比如，抗体水平的检测，用不同的试剂盒以及不同的实验方法差异会很大。”据宋长绪介绍，目前抗体的检测通常用ELISA法与金标试纸条法，但同一样品用这两种实验方法得出的数据差异较大。“养殖场以哪个数据为准?”宋长绪认为，场内监测病毒的动态变化过程比检测抗体来得更加有意义，更能反映疫苗在猪群中的保护率。
