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在不良环境中芽孢杆菌可先形成芽孢，处于休眠状态，具有耐高温、耐挤压、耐氧化、耐酸碱等特点。在适当环境中，芽孢又可以复活，并大量繁殖。
由于生存于多种环境中，芽孢杆菌具有丰富的产酶系统，可利用多种营养物质种类，能产生蛋白酶、淀粉酶、β-葡聚糖酶、植酸酶、果胶酶和木聚糖酶等十几种酶。利用现代基因工程技术，枯草芽孢杆菌可以于短期内大量生产任何种源的酶。目前在工业酶的生产中，枯草芽孢杆菌被用于大量生产蛋白酶、淀粉酶、植酸酶等，其产量占据总工业酶量的50%。
某些芽孢杆菌，像地衣芽孢杆菌对葡萄球菌、白色念珠菌体外实验有很强的拮抗作用。因为地衣芽孢杆菌在生长代谢过程能产生多种抗菌物质．如短杆菌肽、枯草菌素、多粘菌素、制霉菌素和头孢菌素C等。枯草芽孢杆菌对常见的致病性大肠杆菌、沙门氏菌和金黄色葡萄球菌都有较强的抑制作用。芽孢杆菌在生长过程中，可分泌蛋白酶、淀粉酶和脂肪酶等多种有助于消化吸收的酶类，在降低和消除抗营养因子的抗营养作用也具有重要作用。在一定条件下能产生抗逆性内生孢子，可以产生脂肽类、肽类、磷脂类、多烯类和氨基酸类等多种抗生素，对多种病原菌起到很好的抑制作用。同时能产生多种营养物质如维生素、氨基酸、有机酸、促生长因子等，参与动物机体新陈代谢，为机体提供营养物质。
芽孢杆菌在养猪饲料中的应用
主要有以下几个方面：①调节猪的胃肠道微生态平衡。枯草芽孢杆菌的大量繁殖，分泌大量抗菌物质，通过产
酸降低肠道的pH值，从而抑制部分沙门氏菌、链球菌等病原菌的生长与繁殖，降低仔猪腹泻。同时，作为好氧菌，其通过消耗氧气，为肠源寄生的厌氧菌如乳酸杆菌、双歧杆菌等提供无氧环境，间接促
进内源性有益厌氧菌的生长与繁殖。大量的研究结果表明，枯草芽孢杆菌对沙门氏菌、链球菌和梭菌等具有很强的抑制功能。②具有良好的抗病治病作用。除了通过调节胃肠道的微生态平衡降低疾病发生外，还能通过刺激肠猪的免疫细胞分泌免疫球蛋白，提高机体的免疫力，从而减少包括消化系统在内的各个系统的发病率。③提高消化率，促进猪的生长。由于枯草芽孢杆菌能分泌各种酶类，从而提高饲料中营养物质的消化率，促进猪的生长。
芽孢杆菌在环境防治中的应用
对猪粪的无公害化处理 由于芽孢杆菌生存能力强，能充分利用猪粪液中的营养物质大量繁殖，抢夺了沙门氏菌与志贺氏菌生长的生存空间和营养来源，限制了病原菌的繁殖．这种拮抗作用在生物界是普遍的。要对畜禽粪便进行无害化处理，应该对微生物之间的拮抗关系加以利用，应用地衣芽孢杆菌处理猪粪液，既能将NH3转化为生物量，又能抑制病原菌，是一种理想途径。因此，适当在饲料或者环境中增加芽孢杆菌，有益于猪群整体健康，像护舍安这类型的环境改良剂，喷洒在环境中，可以增加环境中芽孢杆菌数量，分解有害微生物。
